Sobre os mecanismos de conquista da América, muitos autores colocam como causa da dizimação das populações indígenas a ação violenta dos espanhois durante os primeiros anos de invasão. No entanto, pesquisas históricas recentes apontam outras causas, além da guerra declarada, das quais podemos destacar:

• a ausência de técnicas bélicas por parte das populações indígenas, diante do numeroso exército espanhol.
• a incapacidade das populações indígenas em se adaptarem aos padrões culturais do colonizador.
• as trocas de mercadorias com os nativos, estimuladas pelos colonizadores, tornando a conquista um processo pacífico.
• a série de doenças trazidas pelos espanhóis, como varíola, tifo e gripe, para as quais as populações indígenas não possuíam defesa.
• a passividade completa das populações indígenas, decorrente de suas crenças religiosas.